1961 yılında Emirdağ’da dünyaya geldi. İlkokulu Eskişehir Hamidiye ilkokulunda, ortaokulu Eskişehir Süleyman Çakır Kız Lisesi’nde bitirdi. Lise öğrencisi iken AFS (American Field Service) sınavını kazanarak burslu olarak Amerika Birleşik Devletleri, Pittsburgh şehrine gitti ve liseyi burada (Greater Latrobe High School) tamamladı.
Anadolu Üniversitesi Eskişehir Tıp Fakültesi’ni kazandı ve 1985 yılında fakülteden ikincilik derecesi ile mezun olarak doktor oldu. 1985-1987 yılları arasında Çorum Devlet Hastanesi’nde zorunlu hizmetini yaptı.
1987 yılında Eskişehir Tıp Fakültesi’nde iç hastalıkları asistanlığına başlayarak 1991 yılında iç hastalıkları uzmanı oldu. Takiben aynı yerde akademik kariyere devam ederek, öğretim görevlisi ve arkasından yardımcı doçentliğe atandı. İç hastalıkları uzmanlığının sonrası gastroenteroloji üst ihtisası yaparak 1996 yılında gastroenteroloji uzmanı oldu. 2001 yılında doçent, 2007 yılında da profesör oldu. Halen Eskişehir Osmangazi Üniversitesi Tıp Fakültesi’nde öğretim üyesi olan Dr. Harmancı Özakyol üniversitede tıp öğrencisi, iç hastalıkları uzmanı ve gastroenteroloji uzmanı yetişmesine katkıda bulunmaktadır.
Türk Gastroenteroloji Dergisinde yayın kurulu hakemliği görevi bulunan Dr. Harmancı Özakyol iyi derecede İngilizce bilmektedir.
2005-2012 yılları arasında Eskişehir Osmangazi Üniversitesi Tıp Fakültesi gastroenteroloji bilim dalı başkanlığını yürütmüştür. 2007 yılında ve 2009 yılında iki kez Eskişehir Bilecik Tabip Odası Onur Kurulu Üyeliğine seçilmiştir. 2010-2013 yılları arasında Eskişehir Osmangazi Üniversitesi Tıp Fakültesi fakülte kurulu üyeliğine ve fakülte yönetim kurulu üyeliğine seçilmiştir. Prof. Dr. Ayşegül Harmancı Özakyol Türk Tabipler Birliği, Türk Gastroenteroloji Derneği, Türk Karaciğer Araştırmaları Derneği, Viral Hepatitle Savaşım Derneği ve Eskişehir İç Hastalıkları Derneği üyesidir.